目前医院污水处理设备处理医疗废水的工艺主要分为两种：一级沉积消毒处理和二级生化消毒处理工艺。

医疗污水处理设备详细处理工艺是可根据出水要求进行选择。当处理废水可排入城市污水管网时，选用一级处理，要求直接排放时，选用二级处理工艺。当选用一级处理流程时，医院污水应与员工生活区污水、雨水分流，仅对医院污水进行消毒处理；当选用二级或深度处理流程时，根据需要，员工生活区污水可与医院污水河流进行处理，但厨房用水有必要设隔油井。

医院污水处理原则：就近消灭，分类收集、分类处理。其实医院污水主要处理技术就是消毒，因为污水中多污染物就是病原体、传染性细菌等，经过消毒之后就和正常污水处理方法即可。处理工艺：消毒+生物处理。

污水处理整个过程为通过粗格栅的原污水经过污水泵后，经过格栅或者筛率器，之后进入沉砂池，经过砂水分离的污水进入初次沉淀池，以上为一级处理（即物理处理），初沉池的出水进入生物处理设备，有活性污泥法和生物膜法，（其中活性污泥法的反应器有曝气池，氧化沟等，生物膜法包括生物滤池、生物转盘、生物接触氧化法和生物流化床），生物处理设备的出水进入二次沉淀池，二沉池的出水经过消毒排放或者进入三级处理，一级处理结束到此为二级处理，三级处理包括生物脱氮除磷法，混凝沉淀法，砂滤法，活性炭吸附法，离子交换法和电渗析法。二沉池的污泥一部分回流至初次沉淀池或者生物处理设备，一部分进入污泥浓缩池，之后进入污泥消化池，经过脱水和干燥设备后，污泥被 利用。